Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms