Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A2Q13183 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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