Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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