Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCLMP48507 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCLMP48507 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCLMP48507 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCLMP48507 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCLMP48507 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCLMP48507 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms