Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms