Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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