Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RNF7Q9UBF6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RNF7Q9UBF6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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