Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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