Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms