Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT35Q92764 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms