Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 498 ms