Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms