Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms