Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GPS1Q13098 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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