Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms