Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms