Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms