Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms