Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms