Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCLNQ969V3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms