Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms