Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CDO1Q16878 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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