Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms