Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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