Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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