Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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CUL4AQ13619 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CUL4AQ13619 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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