Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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