Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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