Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms