Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms