Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms