Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms