Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms