Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms