Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC4Q92889 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms