Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SETD9Q8NE22 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms