Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms