Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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