Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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