Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms