Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN7P35236 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms