Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTX3P26022 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms