Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms