Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms