Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms