Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms