Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF439Q8NDP4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF439Q8NDP4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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