Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHOD3Q2V2M9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FHOD3Q2V2M9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms