Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SGCBQ16585 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SGCBQ16585 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SGCBQ16585 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCBQ16585 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCBQ16585 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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