Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU5F1Q01860 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms